174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0281 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 214 aa  447  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.81 
 
 		 226 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  60.3 
 
 		 213 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  31.62 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  32.23 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  31.4 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  36.46 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  28.68 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.51 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.77 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  33.01 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.71 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.33 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.36 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30.3 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.91 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.68 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.41 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.41 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  34.34 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 		 155 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.16 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  28.45 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.41 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 		 157 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  26.83 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  29.36 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.45 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  28.45 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  29.41 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.93 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.31 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  24.24 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  30.51 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  24.79 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  26.24 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  32.65 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.17 
 
 		 152 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.22 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  26.24 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.32 
 
 		 155 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  29.63 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.43 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  29 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.47 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.45 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  29.52 
 
 		 145 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  24.81 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  26.98 
 
 		 146 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.43 
 
 		 145 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.64 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.19 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  25.42 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.31 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.56 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.1 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  23.97 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.43 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.79 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.48 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 159 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  34 
 
 		 158 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.5 
 
 		 153 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.02 
 
 		 157 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.63 
 
 		 156 aa  51.6  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25.62 
 
 		 170 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.81 
 
 		 145 aa  51.6  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2734  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  0.368548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  23.19 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  23.19 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  28.21 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  21.9 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  27.55 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  29.23 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  25.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  24.11 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.75 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  25 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>