187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2478 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 226 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  76.53 
 
 		 213 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  61.81 
 
 		 214 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.81 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.81 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  32.52 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.13 
 
 		 143 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.13 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.85 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.85 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.48 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  33.07 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  30.08 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.79 
 
 		 159 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 		 189 aa  62  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  29.84 
 
 		 157 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.1 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.1 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.1 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  34.31 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  33.04 
 
 		 162 aa  58.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  27.61 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.31 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.1 
 
 		 159 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.1 
 
 		 159 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.67 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  29.66 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  29.82 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.53 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  30.7 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.65 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.82 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.12 
 
 		 145 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.84 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.95 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  28.95 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  23.84 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.25 
 
 		 163 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.27 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.12 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  30.09 
 
 		 154 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  26.12 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.17 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  29.82 
 
 		 163 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  30.86 
 
 		 144 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.82 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  26.61 
 
 		 157 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.46 
 
 		 147 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.21 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  28.33 
 
 		 149 aa  52  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  26.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  26.5 
 
 		 185 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.35 
 
 		 146 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  26.61 
 
 		 167 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.95 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  25.37 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.15 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.09 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.83 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.59 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  26.85 
 
 		 144 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.7 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  25.76 
 
 		 159 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  28.69 
 
 		 150 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.87 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  28.81 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  30.97 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  24.63 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.19 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  26.09 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  27.87 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  27.87 
 
 		 149 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.71 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 149 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  27.48 
 
 		 179 aa  49.3  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.45 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  27.05 
 
 		 149 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.45 
 
 		 150 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>