100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4627 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
183 aa  362  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  67.96 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  67.96 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  67.96 
 
 
190 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  57.23 
 
 
188 aa  204  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  61.68 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  59.12 
 
 
191 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  35.81 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32.65 
 
 
170 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  34.72 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  29.88 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.79 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.48 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  30 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  32.43 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 
174 aa  61.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.32 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 
229 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  34.68 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  28.19 
 
 
234 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  30.66 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.93 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.84 
 
 
217 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 
176 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
185 aa  54.7  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.58 
 
 
283 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  32.77 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  31.14 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.39 
 
 
150 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  28.69 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.57 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  31.07 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 
214 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
173 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.56 
 
 
152 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.03 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  26.28 
 
 
859 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  28.03 
 
 
179 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  24.43 
 
 
193 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.16 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  29.17 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.69 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.69 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.69 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.74 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.69 
 
 
220 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
147 aa  44.7  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  26.09 
 
 
158 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 
176 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  25.87 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.94 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.61 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 
193 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  26.02 
 
 
178 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
143 aa  42.4  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.01 
 
 
163 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 
146 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.17 
 
 
143 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.05 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2452  hypothetical protein  34.11 
 
 
148 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  32.46 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  33.98 
 
 
156 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.21 
 
 
145 aa  41.2  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  32.81 
 
 
143 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>