203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3973 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3973  transposase  100 
 
 		 213 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  76.53 
 
 		 226 aa  343  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  60.3 
 
 		 214 aa  241  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.62 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.65 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.65 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  35 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 159 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32.54 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.08 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.48 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  33.61 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  32.35 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 		 159 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.15 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.73 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.15 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  29.32 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.99 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.25 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.2 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  32.63 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  31.15 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  28.81 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  26.89 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.2 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.05 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  34.68 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.57 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.59 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  26.89 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  31.36 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.4 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.03 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  31.31 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.7 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  28.7 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.37 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.66 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.59 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.7 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.89 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.31 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.38 
 
 		 151 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.25 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.53 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  33.01 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  26.5 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  26.5 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.35 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.57 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.35 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.2 
 
 		 152 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.53 
 
 		 159 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 157 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  33.67 
 
 		 145 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  27.59 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  28.12 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.29 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  28.12 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  28.68 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  27.59 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.59 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  26.05 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  27.34 
 
 		 151 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.47 
 
 		 145 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  29.47 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.9 
 
 		 152 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>