117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3712 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  48.66 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  46.56 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  45.6 
 
 		 176 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  49.66 
 
 		 187 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  43.41 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  39.57 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  37.16 
 
 		 176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  36.87 
 
 		 173 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  40.11 
 
 		 194 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  36.52 
 
 		 217 aa  111  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.04 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.82 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.67 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  36.67 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  39.42 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  36.71 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.37 
 
 		 178 aa  97.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  38.41 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  38.51 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  31.69 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  30.34 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.51 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.4 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.45 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  32.21 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.43 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.76 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  25.17 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  31.65 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.83 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.73 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  26.06 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.99 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.15 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.49 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  25.32 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.64 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  29.46 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30.28 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  22.79 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  31.51 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  26.98 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  31.51 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  22.73 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  29.92 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  34 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  30.25 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  30.3 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  29.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  23.42 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  25.89 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  31.11 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.63 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  26.11 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  30.91 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.56 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  27.73 
 
 		 859 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  29.55 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.76 
 
 		 172 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  28.65 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.68 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  27.94 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  24.87 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>