241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1976 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  99.45 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  98.9 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  98.9 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  98.9 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  98.9 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  98.9 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  98.9 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  53.22 
 
 		 189 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.73 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  34.91 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  33.13 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  32.04 
 
 		 509 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  34.36 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.22 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.54 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  30.52 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.18 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  30.86 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  30.86 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  29.21 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  37.76 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.04 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.27 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.59 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  35.14 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.74 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  32.8 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  36.44 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  36.44 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.4 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.91 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.91 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  31.69 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.84 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  40.19 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.94 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  36.94 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.86 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  36.04 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.58 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  36.04 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.84 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.65 
 
 		 155 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  37.84 
 
 		 149 aa  62  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.91 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  33.04 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  33.04 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.69 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.04 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.17 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.46 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  33.93 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  35.96 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  35.19 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.76 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  31.45 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  34.96 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  34.04 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.07 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.95 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  36.29 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.54 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  33.63 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.75 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.94 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3437  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.51 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  31.58 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  34.55 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.51 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  35.25 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  30.17 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.91 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.08 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.74 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.25 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.9 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  35.25 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.57 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>