229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3522 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
189 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  46.74 
 
 
509 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  47.28 
 
 
192 aa  170  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  46.2 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  46.2 
 
 
192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  46.2 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  45.65 
 
 
204 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
184 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.8 
 
 
197 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  37.97 
 
 
189 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  32.79 
 
 
201 aa  101  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.22 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  30.22 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  30.22 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.22 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.22 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.22 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.22 
 
 
182 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  29.81 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  29.81 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 
206 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.12 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  31.68 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.71 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.28 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.46 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.16 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.45 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  32.81 
 
 
159 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  35.42 
 
 
113 aa  62.4  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  30.33 
 
 
144 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 
150 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  32.11 
 
 
153 aa  61.2  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  29.05 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.76 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  30.58 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  30.36 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.67 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.9 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.77 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.58 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  32.67 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 
151 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.3 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 
163 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  32.43 
 
 
157 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 
151 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  29.85 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  29.09 
 
 
150 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  33.02 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 
146 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.82 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  24.41 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  30.53 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
151 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.66 
 
 
150 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.55 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.35 
 
 
150 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  34 
 
 
146 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.75 
 
 
159 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  33.64 
 
 
149 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  29.01 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.31 
 
 
158 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.01 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.66 
 
 
152 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.85 
 
 
152 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  28.24 
 
 
145 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  32.81 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.45 
 
 
151 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.77 
 
 
159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2452  hypothetical protein  32.11 
 
 
148 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  29.77 
 
 
159 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  31.53 
 
 
151 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
145 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.91 
 
 
145 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  27.64 
 
 
159 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  25.83 
 
 
167 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 
143 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  27.97 
 
 
159 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.17 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.94 
 
 
149 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>