77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2362 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  221  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  40.2 
 
 		 509 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  36 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  40.24 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  37.5 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  37.5 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  36.27 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3899  hypothetical protein  40.62 
 
 		 96 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00567154  normal  0.0318499 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  37.25 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  32.53 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  35.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  35.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.42 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.42 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  30.68 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.47 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 203 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  29.11 
 
 		 196 aa  48.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  23.86 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  32.61 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.53 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  32.56 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  32.26 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  32.56 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 188 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.53 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.26 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.63 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.25 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  32.1 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  25.29 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.33 
 
 		 180 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  34.07 
 
 		 158 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 181 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.15 
 
 		 152 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.18 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.18 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.71 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.15 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.68 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.99 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  30.23 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  29.03 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  28.38 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35 
 
 		 283 aa  40.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  25.56 
 
 		 154 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>