35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3899 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3899  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  193  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00567154  normal  0.0318499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 
182 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  34.15 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  40.68 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  35 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  37.88 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32.93 
 
 
170 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  35.38 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.04 
 
 
189 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  35.29 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  35.29 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.08 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  35.29 
 
 
207 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2734  hypothetical protein  33.87 
 
 
279 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  0.368548 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  30.3 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.19 
 
 
180 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  36.92 
 
 
509 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  35.09 
 
 
207 aa  41.2  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  35.71 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  29.27 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 
203 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  36.54 
 
 
204 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>