75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2734 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2734  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  0.368548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3802  hypothetical protein  81.43 
 
 
280 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.639259  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3438  hypothetical protein  64.36 
 
 
278 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3490  hypothetical protein  64.73 
 
 
278 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.724398  normal  0.299484 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3427  hypothetical protein  64.73 
 
 
278 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12336  hypothetical protein  51.65 
 
 
284 aa  268  8e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  32.79 
 
 
150 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  21.93 
 
 
185 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  21.93 
 
 
185 aa  56.2  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.36 
 
 
150 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  30.19 
 
 
145 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.25 
 
 
145 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.03 
 
 
145 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.69 
 
 
145 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  27.03 
 
 
149 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
214 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.01 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 
157 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
182 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.91 
 
 
145 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.03 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.76 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.03 
 
 
145 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
182 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.57 
 
 
182 aa  49.3  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  23.81 
 
 
145 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  27.87 
 
 
145 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  27.78 
 
 
145 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.18 
 
 
152 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  26.36 
 
 
149 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.81 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  26.36 
 
 
158 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
205 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  23.81 
 
 
145 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  23.81 
 
 
145 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  22.73 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.14 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  33 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  24.76 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  25.96 
 
 
188 aa  46.2  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.05 
 
 
145 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  24.77 
 
 
158 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  22.86 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.13 
 
 
145 aa  45.8  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  27.93 
 
 
149 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  25.45 
 
 
149 aa  45.8  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  23.28 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.59 
 
 
153 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  29.1 
 
 
151 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  25.23 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.42 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  25.47 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  20.69 
 
 
154 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.79 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  26.72 
 
 
146 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  27.03 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  32.58 
 
 
169 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.56 
 
 
152 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  25.22 
 
 
149 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  24.53 
 
 
162 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2219  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 
147 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108098  normal  0.214163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.23 
 
 
156 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 
152 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  26.42 
 
 
145 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  25.62 
 
 
195 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  23.68 
 
 
207 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3899  hypothetical protein  33.87 
 
 
96 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00567154  normal  0.0318499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  23.93 
 
 
167 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>