58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0598 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 169 aa  338  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  56.21 
 
 		 173 aa  184  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  39.62 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.52 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  26.8 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3596  hypothetical protein  33.9 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1286  hypothetical protein  27.05 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1522  hypothetical protein  24.82 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1279  hypothetical protein  23.36 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.966025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3928  hypothetical protein  24.09 
 
 		 137 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1381  hypothetical protein  23.36 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0666475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1480  hypothetical protein  24.09 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1251  hypothetical protein  23.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00369422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1453  hypothetical protein  24.09 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.352476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  33.57 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1415  hypothetical protein  23.36 
 
 		 137 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1938  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 		 196 aa  48.1  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0420591  normal  0.0162629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1085  hypothetical protein  24.09 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  31.58 
 
 		 170 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1026  carboxymuconolactone decarboxylase  28.14 
 
 		 199 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.37 
 
 		 182 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  28.29 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  29.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  29.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.37 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.37 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  36.99 
 
 		 509 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.67 
 
 		 182 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3802  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.639259  normal  0.287636 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2734  hypothetical protein  32.58 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  0.368548 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1253  hypothetical protein  23.36 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.649037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12336  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.61 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.3 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  33.04 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  39.05 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  39.05 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  22.3 
 
 		 201 aa  42  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  27.83 
 
 		 196 aa  42  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.95 
 
 		 153 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  29.93 
 
 		 188 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  25.9 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  25.9 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  30.77 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  30.69 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  28.38 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>