152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3715 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  64.61 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  46.89 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  40.76 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  40.45 
 
 		 160 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  39.16 
 
 		 160 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.97 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  33.97 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  33.97 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.97 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.62 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  32.05 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.65 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  36 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  32.82 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  34.78 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.25 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  35.38 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  35.38 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.47 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  31.41 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.78 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.87 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.2 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  30.13 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  33.88 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.53 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.59 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.06 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.47 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.07 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 152 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  26.44 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.23 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.16 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  31.54 
 
 		 145 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.3 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.3 
 
 		 163 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  28.68 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.42 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.77 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.33 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.28 
 
 		 161 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 		 157 aa  52  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.9 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.16 
 
 		 283 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.47 
 
 		 146 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  24.84 
 
 		 156 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  30.5 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.54 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.26 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.17 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  33.07 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  25.68 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 150 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.33 
 
 		 150 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2902  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.58 
 
 		 148 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.79 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.4 
 
 		 159 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.8 
 
 		 159 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  31.09 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.16 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  29.31 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 		 163 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  23.38 
 
 		 149 aa  48.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  28.23 
 
 		 151 aa  47.8  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.46 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3742  alkylhydroperoxidase  36.9 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  29.85 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.51 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.1 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  29.08 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.96 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>