132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5963 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 159 aa  327  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  74.68 
 
 		 170 aa  254  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  42.05 
 
 		 184 aa  130  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  38.89 
 
 		 188 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  39.55 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  36.52 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  33.81 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.82 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.28 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.71 
 
 		 283 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  28.97 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.25 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.88 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.74 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.33 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  37.17 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  37.17 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.86 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.55 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  34.95 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.51 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  33.98 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  37 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1900  carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.429889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.61 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  33.63 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.63 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.63 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  33.63 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  33.63 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.63 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.63 
 
 		 182 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.35 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  32.35 
 
 		 145 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.91 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.74 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  31.03 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.71 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.55 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.55 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.55 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.35 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  30.34 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.04 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  32.04 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  32.69 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  35 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.1 
 
 		 152 aa  48.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.58 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.96 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.38 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  34 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.92 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  28.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  28.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.17 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  31.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.79 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.79 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  26.79 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.69 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0882  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.66 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0899  alkylhydroperoxidase  30.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0888  alkylhydroperoxidase  30.94 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.302466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  27.93 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.46 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  25.83 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.07 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  27.48 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  24.17 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.61 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  31.3 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.82 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  31.75 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  30.08 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  24.51 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  30.14 
 
 		 88 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>