92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1838 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  38.27 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  40.24 
 
 
113 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  44.62 
 
 
180 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 
196 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1938  carboxymuconolactone decarboxylase  34.57 
 
 
196 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0420591  normal  0.0162629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.98 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.51 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  39.02 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.74 
 
 
156 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  32.93 
 
 
188 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.02 
 
 
158 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  39.02 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.88 
 
 
184 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.9 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.47 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.47 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.47 
 
 
182 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  34.88 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  38.82 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.18 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.51 
 
 
152 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  37.18 
 
 
145 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  36.36 
 
 
509 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.68 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  32.94 
 
 
189 aa  50.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  38.27 
 
 
205 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.71 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.37 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.9 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  33.8 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3899  hypothetical protein  35 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00567154  normal  0.0318499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8871  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
161 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  35.21 
 
 
185 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 
150 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.06 
 
 
155 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  32.91 
 
 
207 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  31.65 
 
 
192 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  32.91 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  32.91 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  31.4 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.4 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  34.72 
 
 
188 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.23 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.4 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2353  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 
152 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  35.96 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  32.95 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  31.11 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  33.77 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.86 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  33.75 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0662  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.36 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236463  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.71 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.23 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  39.44 
 
 
195 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.82 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3437  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330272  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
145 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
145 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.73 
 
 
143 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.07 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.76 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  32.56 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.07 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.52 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.76 
 
 
192 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.73 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.86 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.59 
 
 
199 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  27.91 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  30.23 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
159 aa  40  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.88 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 
195 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5352  hypothetical protein  38.27 
 
 
151 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.91 
 
 
147 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
159 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  29.07 
 
 
159 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>