252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2144 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  48.77 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  48.19 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  46.71 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  46.59 
 
 		 172 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.92 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  45.95 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  36 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  37.25 
 
 		 234 aa  98.6  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  37.71 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  39.19 
 
 		 180 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  37.32 
 
 		 177 aa  90.9  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  34.46 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.95 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.95 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.95 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  36.07 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.65 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  33.58 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  35.56 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  32.19 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  31.29 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  32.33 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  32.19 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  30.88 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.94 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  29.75 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.94 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  33.61 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3104  alkylhydroperoxidase  33.09 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  32.59 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  32.2 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.2 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.29 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 		 183 aa  62  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  32.48 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  31.11 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.24 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.05 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  31.36 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.8 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.65 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.3 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  35.09 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  30.77 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.2 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  28.81 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  30.25 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  30.25 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  27.59 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.25 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  29.33 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.25 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.81 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.81 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  28.81 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.25 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  34.19 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.03 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  28.74 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.61 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.58 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  25.2 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  29.09 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.83 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  31.53 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  31.67 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.65 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  26.47 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  29.81 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  30.16 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.63 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.56 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.85 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>