148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3926 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1938  carboxymuconolactone decarboxylase  52.41 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0420591  normal  0.0162629 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02815  probable fusion protein  49.49 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.159587  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  45.51 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.16 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.55 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.91 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1838  hypothetical protein  34.57 
 
 		 88 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  33.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.41 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.17 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.17 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.3 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  30.07 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4868  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.31 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.405716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.26 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  29.37 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.37 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1945  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.56 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2723  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.27 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.114348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2093  hypothetical protein  31.47 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.868254 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.07 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  23.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  23.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  25.79 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1186  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.48 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.98 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.79 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.83 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0121  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.42 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.464175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.11 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  26.49 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  26.71 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.88 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.79 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  28.73 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  24.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  27.5 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  24.53 
 
 		 172 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  28.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  28.15 
 
 		 154 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.11 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  25.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  20.51 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3877  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.51 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.42439  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.42 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  25.99 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  24.16 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  23.53 
 
 		 509 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  34.88 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  24.16 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.44 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  26.58 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  27.01 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  23.81 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  27.01 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  26.72 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3260  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.49 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3281  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.7 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.366271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.03 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  26.4 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  26.85 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  23.58 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30 
 
 		 145 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.32 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  24.14 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.57 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.73 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.09 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.81 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3133  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.39 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  30.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.86 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  30 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.16 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.15 
 
 		 159 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.11 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6041  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.88 
 
 		 152 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  29.32 
 
 		 143 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.27 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  25 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.38 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.38 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  25 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>