251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3847 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  45.29 
 
 
195 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.38 
 
 
197 aa  147  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 
203 aa  135  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  43.26 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.78 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  35.83 
 
 
509 aa  108  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  34.76 
 
 
207 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  37.16 
 
 
192 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  35.16 
 
 
192 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  35.16 
 
 
192 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.73 
 
 
182 aa  104  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.64 
 
 
182 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.73 
 
 
182 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.73 
 
 
182 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  38.73 
 
 
182 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.33 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  36.9 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  33.71 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  31.65 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  31.65 
 
 
185 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  41.05 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  34.21 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.76 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  32.2 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.48 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  32.48 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.65 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.13 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.85 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  29.91 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  29.31 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  34.26 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  34.26 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.83 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.62 
 
 
145 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.7 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
154 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  30.6 
 
 
157 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 
143 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  30.43 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  24.62 
 
 
147 aa  62.4  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.36 
 
 
283 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
152 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.41 
 
 
159 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.73 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  25.38 
 
 
147 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.35 
 
 
159 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 
145 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  35.64 
 
 
157 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.43 
 
 
159 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.98 
 
 
159 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.76 
 
 
148 aa  61.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  29.75 
 
 
145 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.62 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 
155 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.47 
 
 
152 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.06 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.17 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  27.73 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2023  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.81 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0330638 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  29.55 
 
 
145 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  29.36 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.19 
 
 
143 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.57 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.14 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  28.26 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.73 
 
 
159 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.04 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.91 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.93 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.3 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.41 
 
 
143 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.62 
 
 
145 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  32.17 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.48 
 
 
143 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.66 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.91 
 
 
149 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  29.66 
 
 
145 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.2 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 
214 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  29.09 
 
 
153 aa  58.5  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>