122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0284 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  58.82 
 
 
197 aa  225  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  52.15 
 
 
201 aa  202  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  46.7 
 
 
195 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.78 
 
 
203 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.2 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  34.74 
 
 
192 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  34.74 
 
 
192 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  35.96 
 
 
509 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  37.17 
 
 
204 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  35.42 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.33 
 
 
189 aa  77  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.401877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.12 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.46 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  23.23 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.85 
 
 
159 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.69 
 
 
159 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  28.71 
 
 
185 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.69 
 
 
159 aa  54.7  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  23.26 
 
 
156 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.69 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.35 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  28.35 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.47 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.01 
 
 
145 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  31.78 
 
 
113 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  26.12 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  28.35 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.15 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  27.61 
 
 
159 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  29.9 
 
 
189 aa  52  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.18 
 
 
150 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  30.77 
 
 
150 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  28.72 
 
 
159 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  30.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  30.84 
 
 
159 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  24.62 
 
 
159 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.52 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
152 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.92 
 
 
159 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.06 
 
 
163 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  29.59 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  29.59 
 
 
144 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  23.88 
 
 
145 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  27.93 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  25.87 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  29.23 
 
 
143 aa  49.3  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.99 
 
 
163 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.23 
 
 
145 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.57 
 
 
144 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.57 
 
 
144 aa  48.5  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25 
 
 
154 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  28.57 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  28.57 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  28.57 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.36 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  25.95 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.69 
 
 
143 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  28.36 
 
 
145 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.26 
 
 
163 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.48 
 
 
145 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.72 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.69 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  30.51 
 
 
170 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.08 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.72 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  23.08 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  27.78 
 
 
159 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.95 
 
 
145 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.55 
 
 
283 aa  45.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1341  alkylhydroperoxidase  26.44 
 
 
156 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.728032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.95 
 
 
155 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  23.48 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.01 
 
 
165 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.01 
 
 
165 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 
151 aa  45.1  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.43 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.66 
 
 
150 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.85 
 
 
156 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2501  alkylhydroperoxidase  25.6 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2551  alkylhydroperoxidase  25.6 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25.21 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.26 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.05 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>