199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3968 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3968  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.33 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0431  alkylhydroperoxidase  38.46 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  47.06 
 
 		 113 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13359  transposase  34.42 
 
 		 509 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.04338e-22  normal  0.800314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3171  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.18 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.61 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.18 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.18 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  31.61 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.61 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  33.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  33.33 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1576  hypothetical protein  35.14 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  31.61 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  31.61 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.61 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  33.55 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3522  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.12 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.401877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5064  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.46 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1688  carboxymuconolactone decarboxylase  32.21 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  31.09 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  31.09 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.5 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  31.01 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  32.79 
 
 		 159 aa  62  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.06 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.6 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.94 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0284  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.12 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.6 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.66 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  35.04 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1217  hypothetical protein  26.53 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  29.06 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1184  alkylhydroperoxidase  28.19 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.22 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.22 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  28 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  28 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.75 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  26.06 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.63 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  26.06 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.32 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.32 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  28.36 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  26.98 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.1 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  28.83 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  26.23 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  34.21 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.91 
 
 		 152 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1327  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.83 
 
 		 150 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.284107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  27.46 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  26.77 
 
 		 159 aa  51.2  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  25.66 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.5 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  29.77 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  29.5 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.06 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  29.5 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.36 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  26.76 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.37 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  22.76 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  28.46 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.36 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  25.64 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.22 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  26.24 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 162 aa  48.5  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0891  carboxymuconolactone decarboxylase  31.78 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.911286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2657  hypothetical protein  31.3 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  31.43 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.35 
 
 		 146 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.09 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.32 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  26.09 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  26.96 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 		 143 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.43 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.4 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  29.2 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>