73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1057 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  43.75 
 
 
180 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  36.11 
 
 
174 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.64 
 
 
178 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  41.67 
 
 
234 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  38.51 
 
 
170 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  39.49 
 
 
186 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  35.39 
 
 
172 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  34.46 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  34.46 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.05 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
174 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 
184 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  25.62 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.8 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  25.97 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  25.97 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 
178 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.02 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  30.28 
 
 
188 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 
179 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  23.33 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  31.4 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.35 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  29.51 
 
 
145 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
190 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  29.75 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  28.35 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
184 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1251  putative transposase fusion protein  31.11 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  28.69 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.73 
 
 
229 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.97 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4851  hypothetical protein  32.28 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  30.61 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  30 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.62 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.7 
 
 
283 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  28.88 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  27.19 
 
 
213 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.53 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1241  putative transposase fusion protein  29.93 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1224  putative transposase fusion protein  29.93 
 
 
192 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.22 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 
226 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2362  hypothetical protein  40.62 
 
 
113 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.671484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  25.53 
 
 
205 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  26.77 
 
 
207 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  25.31 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  25.31 
 
 
185 aa  41.2  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 
198 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  24.44 
 
 
217 aa  41.2  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  30.56 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.13 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
149 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>