87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5304 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
191 aa  380  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  78.84 
 
 
189 aa  290  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  59.12 
 
 
183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 
190 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 
190 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 
190 aa  190  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  50.81 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  35.93 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.18 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.95 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  32.19 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  28.65 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  30.92 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  31.76 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  32.12 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.96 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32 
 
 
170 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.14 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  33.82 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  32.24 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.91 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  32.54 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  28.64 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  30.29 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
179 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.81 
 
 
173 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  27.54 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.14 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
185 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  22.73 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 
184 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.71 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.95 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.45 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.84 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 
180 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.76 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  30.07 
 
 
192 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  26.09 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.36 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.36 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  29.78 
 
 
190 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.66 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.87 
 
 
143 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.17 
 
 
145 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.84 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  32.17 
 
 
149 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.12 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  22.31 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.57 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.08 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.69 
 
 
180 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  30.95 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30 
 
 
283 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.3 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.57 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.04 
 
 
153 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  22.69 
 
 
859 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  23.65 
 
 
186 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.3 
 
 
145 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>