91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11564 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  52.15 
 
 
190 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  54.44 
 
 
183 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  52.15 
 
 
190 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  52.15 
 
 
190 aa  210  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  50.81 
 
 
191 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
189 aa  167  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  32.02 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.24 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  34.76 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  34.76 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  34.76 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.98 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  33.56 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  31.29 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.05 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  27.91 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.91 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  32.19 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  31.33 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.25 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  24.86 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  31.36 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.9 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  25.9 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  24.4 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  26.11 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  25.9 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.3 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30.07 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 
185 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.14 
 
 
185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.55 
 
 
283 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  25.42 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.51 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.42 
 
 
214 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.84 
 
 
180 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  33.04 
 
 
198 aa  52  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  28.79 
 
 
150 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.99 
 
 
191 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.49 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  30.77 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 
226 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  23.36 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
181 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  25.36 
 
 
217 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  22.73 
 
 
207 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  25.41 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  22.08 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.82 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  24.06 
 
 
204 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  24.24 
 
 
173 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  26.85 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 
172 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.52 
 
 
180 aa  45.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  32.04 
 
 
156 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  22.64 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  21.59 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  22.86 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  23.57 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  25.44 
 
 
144 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  23.28 
 
 
859 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.98 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>