79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0110 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
179 aa  363  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  88.64 
 
 
180 aa  321  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  82.39 
 
 
178 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  82.39 
 
 
178 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  82.39 
 
 
178 aa  291  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.57 
 
 
178 aa  168  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  49.46 
 
 
190 aa  157  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 
186 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.01 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 
220 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  42.29 
 
 
187 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  34.25 
 
 
187 aa  95.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  30.71 
 
 
217 aa  74.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.11 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.39 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.76 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  32.4 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  29.61 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 
859 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  27.78 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 
186 aa  60.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  28.12 
 
 
170 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  30.16 
 
 
184 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.06 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.06 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  27.56 
 
 
186 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.06 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.35 
 
 
174 aa  54.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  25.9 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  26.85 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  29.23 
 
 
214 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.32 
 
 
210 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  38.14 
 
 
190 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  24.12 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
179 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  22.05 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.79 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.9 
 
 
145 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  27.84 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  27.84 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  24.11 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  30.17 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.21 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  33.94 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.12 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.59 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  29.66 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  26.4 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.08 
 
 
145 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.08 
 
 
145 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  26.8 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>