65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0633 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
178 aa  358  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  82.39 
 
 
179 aa  291  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  81.82 
 
 
180 aa  290  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.87 
 
 
178 aa  170  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  52.17 
 
 
190 aa  164  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.14 
 
 
186 aa  150  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.53 
 
 
220 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  42.77 
 
 
187 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.48 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  34.9 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  35.19 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
200 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.66 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 
176 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
180 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  29.56 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  28.49 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 
178 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.72 
 
 
180 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.66 
 
 
185 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.66 
 
 
185 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.66 
 
 
185 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 
184 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.7 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  27.12 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
176 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 
859 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1122  carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  34.75 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  25.38 
 
 
211 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.69 
 
 
174 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.78 
 
 
180 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1446  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.85 
 
 
235 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25 
 
 
170 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.07 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6841  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.76 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.36 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.41 
 
 
191 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>