121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3758 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  71.59 
 
 		 176 aa  264  5.999999999999999e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  68.18 
 
 		 176 aa  246  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.91 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  54.91 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  54.91 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  49.12 
 
 		 173 aa  184  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  51.16 
 
 		 176 aa  177  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  48.95 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  41.85 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  41.76 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  40.76 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  39.13 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  40.48 
 
 		 179 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 229 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.07 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.99 
 
 		 194 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.87 
 
 		 186 aa  99.4  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 		 229 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  32.8 
 
 		 217 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.92 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  33.72 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  34.71 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  31.21 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  29.79 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  33.1 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.08 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  31.69 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.09 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  28.37 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  30.57 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  25.99 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  27.92 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  30.86 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.48 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  29.32 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  33.08 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  27.84 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  34.9 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  32.31 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  32.03 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  27.83 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  30.39 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.39 
 
 		 193 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  31.58 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  30.39 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  28.89 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.39 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  34.58 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  26.32 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  29.82 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  32.09 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.07 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  28.32 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  28.7 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>