100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3780 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  99.43 
 
 		 176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  62.57 
 
 		 173 aa  221  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  63.95 
 
 		 178 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  52.33 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  51.74 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  47.09 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.09 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  47.09 
 
 		 185 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  37.7 
 
 		 193 aa  127  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  36.56 
 
 		 190 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  38.95 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.33 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  34.25 
 
 		 217 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.02 
 
 		 229 aa  88.6  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.42 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.97 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  30.5 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.81 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  25.52 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  23.74 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  31.94 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  26.55 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  28.21 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.91 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  23.78 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  27.06 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  25.97 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  25.88 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  25.88 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  25.88 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  25.88 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  25.88 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  27.06 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  29.48 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.92 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.42 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  25.57 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  25.58 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  27.43 
 
 		 190 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  25.81 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.68 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  23.48 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  25.58 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.46 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  28.26 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.58 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  24.42 
 
 		 184 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.46 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  23.53 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  24.71 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  22.15 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  24.71 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  22.05 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.28 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  23.53 
 
 		 177 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 		 190 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  22.54 
 
 		 234 aa  42  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  21.18 
 
 		 181 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  21.77 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  22.65 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  20.59 
 
 		 181 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  28.06 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>