104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4316 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  83.16 
 
 		 200 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  39.23 
 
 		 176 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 176 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 176 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 		 176 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.88 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  37.88 
 
 		 185 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.81 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  36.46 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  34.5 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  36.73 
 
 		 193 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  31.77 
 
 		 187 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 179 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.96 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 		 176 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  31.49 
 
 		 176 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  33.12 
 
 		 189 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  32.62 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32.2 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  33.55 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.56 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  31.06 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.81 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  33.8 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.39 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.58 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  35.2 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  35.04 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.2 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  27.41 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  28.86 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  30 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.87 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  31.69 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 		 180 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  34.15 
 
 		 184 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.28 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.2 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  35.24 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  23.7 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  30.83 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  30.28 
 
 		 184 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  28.85 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  24.46 
 
 		 174 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  28.78 
 
 		 181 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  26.32 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  32.23 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  32.23 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 		 173 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  32.23 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  32.23 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  32.23 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  32.23 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  22.73 
 
 		 180 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.41 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 187 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  24.59 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  29.03 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.5 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 		 181 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  22.14 
 
 		 170 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  26.62 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>