65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3670 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
172 aa  346  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.17 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.25 
 
 
220 aa  152  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  44.19 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.35 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  45.88 
 
 
180 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  42.01 
 
 
179 aa  140  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  40.7 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  39.52 
 
 
190 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.79 
 
 
217 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  32.14 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.9 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 
229 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.35 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.66 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.66 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.66 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  28.06 
 
 
176 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.49 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  29.55 
 
 
190 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 
193 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.62 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  23.68 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
184 aa  54.7  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.5 
 
 
178 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.15 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  24.2 
 
 
229 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.48 
 
 
200 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.17 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  33.58 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.93 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.58 
 
 
181 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  25.29 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  27.12 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.17 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  23.57 
 
 
180 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  24.82 
 
 
177 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 
190 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  28.57 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  22.58 
 
 
183 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  29.03 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.37 
 
 
180 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 
190 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 
190 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 
190 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  27.27 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  26.87 
 
 
207 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.79 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>