135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2163 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
194 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  45.95 
 
 
187 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  40.11 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.96 
 
 
220 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  39.58 
 
 
229 aa  105  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  37.99 
 
 
176 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  37.99 
 
 
176 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  37.99 
 
 
176 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 
176 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 
176 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  37.43 
 
 
176 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 
190 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.01 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  40.28 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  35.36 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  37.67 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  32.8 
 
 
217 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.65 
 
 
179 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  34.97 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  36.11 
 
 
174 aa  87.8  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.16 
 
 
185 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  33.16 
 
 
185 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  33.16 
 
 
185 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 
191 aa  85.5  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  35.06 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.22 
 
 
191 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  33.99 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  35.57 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  37.06 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  37.42 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  35.19 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  34.03 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.5 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.42 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  33.78 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  34.67 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  32.28 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  37.1 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  31.49 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  35.17 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  35.11 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  32.45 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.9 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  28.88 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  35.53 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  35.09 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  30.46 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  31.72 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  29.17 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  31.72 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  31.72 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  31.72 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  31.72 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  31.61 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.93 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  30.23 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  30.14 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.54 
 
 
180 aa  61.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  31.79 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  30.81 
 
 
187 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  29.24 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  30.22 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  28.65 
 
 
207 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  31.28 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  27.78 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 
859 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  30.73 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  30.73 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.32 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  32.2 
 
 
144 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  34.71 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  34.55 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  31.36 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  33.11 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  29.61 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.64 
 
 
172 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  30.73 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  29.61 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  32.73 
 
 
182 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.97 
 
 
172 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  31.91 
 
 
177 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>