55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10471 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  52.17 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.11 
 
 		 178 aa  157  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.86 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  45.56 
 
 		 187 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  34.9 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  35.9 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  34.9 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  34.9 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  34.9 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  29.46 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  30.3 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  29.65 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.76 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  32.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  32.54 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  32.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.66 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  30.41 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.31 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  30.95 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.26 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  27.82 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  24.29 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.32 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  23.31 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.03 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.3 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  28.46 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 		 145 aa  42  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  26.92 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  27.55 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>