98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0757 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 		 178 aa  353  5.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.17 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  50.87 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  50.87 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  50.87 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  50.57 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  48 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.43 
 
 		 220 aa  161  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  49.15 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  47.16 
 
 		 187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  46.67 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  33.7 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.42 
 
 		 179 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  39.01 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  35.37 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 		 217 aa  94.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 		 190 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  36.17 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  34.72 
 
 		 173 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  36.42 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  36.42 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  36.42 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.86 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  34.21 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.99 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.43 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.99 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.99 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  30.17 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  25.76 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.82 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  20.71 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.67 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  20.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  24.32 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.33 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.97 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  29 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.68 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.07 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  29.57 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  24.77 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  32.46 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  27.89 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.91 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  24.43 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  37.68 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  25.76 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  29.47 
 
 		 143 aa  44.3  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.04 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.25 
 
 		 179 aa  44.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  26.06 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  32 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  23.57 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  24.17 
 
 		 234 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  26.71 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.56 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  30.51 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  26.71 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.89 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.1 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  29.25 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  31.91 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  24.48 
 
 		 859 aa  41.6  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.53 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  28.87 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.29 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  29.29 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1695  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.63 
 
 		 157 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  26 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  29.79 
 
 		 180 aa  40.8  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.19 
 
 		 172 aa  40.8  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>