67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3214 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  44.39 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  46.52 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  39.57 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 		 173 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  40.76 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  40.76 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  40.76 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  39.67 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  38.25 
 
 		 178 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.7 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  37.7 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  37.58 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  37.25 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  35.8 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.17 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.12 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.62 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.92 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.88 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  29.21 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.37 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.47 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  27.86 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  30.5 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.08 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.64 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  31.69 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  30.38 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  28.49 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  28.49 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  28.49 
 
 		 178 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  26.09 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  23.75 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.79 
 
 		 177 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  30.25 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  24.11 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  26.35 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  24.43 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  25.32 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  22.77 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  22.22 
 
 		 174 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  24.68 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  22.52 
 
 		 145 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  24.87 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>