66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7488 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 		 184 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  43.55 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  43.24 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  39.34 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  46.67 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  36.97 
 
 		 187 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.47 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.1 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  34.92 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.71 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  36.31 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  32.59 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  36.81 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  32.89 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  29.11 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  30.91 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.46 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.58 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.42 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.96 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.23 
 
 		 229 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.87 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  30.97 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  31.86 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  31.86 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  31.86 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  30.97 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  28.39 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.86 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  29.08 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  28.21 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  26.09 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  23.93 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  23.08 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.53 
 
 		 236 aa  41.6  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  25.62 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>