79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0701 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  80.56 
 
 		 181 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  79.44 
 
 		 181 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  78.89 
 
 		 181 aa  296  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  46.86 
 
 		 182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  40.33 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  41.67 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.72 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  40.24 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.24 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  40.24 
 
 		 193 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  40.24 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  40.24 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  40.24 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  41.42 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  40.24 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  38.76 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  38.32 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.23 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  37.08 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  37.64 
 
 		 184 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  37.57 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  34.88 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.37 
 
 		 236 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  36.91 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  33.97 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  35.82 
 
 		 195 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  32.12 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  33.69 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  31.72 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  32.09 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  29.48 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.13 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.49 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  30.4 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  23.08 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.88 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  33.63 
 
 		 859 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  30.91 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.01 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  27.01 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  27.01 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  25.83 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  24.53 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.56 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.78 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.81 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  22.7 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  26.06 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.57 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.86 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  24.49 
 
 		 186 aa  41.2  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  23.97 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  20.59 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  20.59 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  20.59 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>