81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2352 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  100 
 
 
187 aa  380  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  93.58 
 
 
187 aa  350  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  93.05 
 
 
187 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  93.05 
 
 
193 aa  348  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  93.05 
 
 
193 aa  348  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  93.05 
 
 
187 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  93.05 
 
 
187 aa  349  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  92.51 
 
 
187 aa  345  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  82.32 
 
 
184 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  82.32 
 
 
184 aa  303  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  82.87 
 
 
184 aa  303  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  81.77 
 
 
184 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  82.32 
 
 
184 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  81.22 
 
 
184 aa  299  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  81.77 
 
 
184 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  80.11 
 
 
185 aa  290  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  78.45 
 
 
184 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  75.69 
 
 
184 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.85 
 
 
191 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  48.09 
 
 
185 aa  158  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  44.25 
 
 
181 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  42.78 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.5 
 
 
181 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  42.7 
 
 
181 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  41.42 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  52.21 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  39.76 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  132  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  39.16 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  42.35 
 
 
182 aa  130  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  45.06 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  41.81 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  39.76 
 
 
217 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  33.52 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  38.3 
 
 
149 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  37.42 
 
 
192 aa  94  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  31.32 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  30.81 
 
 
859 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.64 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  28.02 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  31.76 
 
 
176 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  28.02 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.17 
 
 
176 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.13 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.58 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  26.63 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  26.26 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 
213 aa  55.5  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.57 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  33.57 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  26.75 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.92 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.85 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  26.92 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  31.53 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  29.69 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.26 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 
220 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
172 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.14 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.72 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.65 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  28.1 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  29.2 
 
 
234 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.09 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  24.06 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 
180 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>