87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3267 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  98.93 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  98.93 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  98.93 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  98.93 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  98.93 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  98.4 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  92.51 
 
 		 187 aa  336  9e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  81.77 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  81.77 
 
 		 184 aa  296  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  81.22 
 
 		 184 aa  294  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  80.66 
 
 		 184 aa  293  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  80.11 
 
 		 184 aa  292  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  80.66 
 
 		 185 aa  291  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  80.66 
 
 		 184 aa  291  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  79.56 
 
 		 184 aa  287  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  77.35 
 
 		 184 aa  283  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  75.14 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.48 
 
 		 191 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  46.99 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  41.95 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  41.01 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.68 
 
 		 181 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  40.24 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  49.26 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  38.55 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  37.95 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.83 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  38.89 
 
 		 204 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.78 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  40.11 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  37.35 
 
 		 217 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  31.84 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  36.88 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  38.71 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.27 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  29.67 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  31.35 
 
 		 859 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  27.47 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  29.59 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  30.94 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  30.94 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  30.94 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.22 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  26.82 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  26.92 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  29.94 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  26.75 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.53 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.35 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.17 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  32.17 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  32.17 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.85 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  26.86 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  27.06 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  27.06 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.06 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.52 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.19 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  26.28 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  27.46 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.43 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  31.48 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  26.95 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  27.54 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  26.43 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.4 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  28.39 
 
 		 180 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  30.09 
 
 		 186 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.71 
 
 		 178 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  23.48 
 
 		 194 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.16 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.15 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>