74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5286 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  86.11 
 
 		 181 aa  321  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  85.08 
 
 		 181 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  79.44 
 
 		 181 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  47.43 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 185 aa  150  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  40.33 
 
 		 184 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  41.92 
 
 		 185 aa  137  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.72 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  43.5 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.24 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  41.24 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  41.24 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  41.24 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  41.24 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  41.24 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.81 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  40.68 
 
 		 187 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  35.8 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  35.63 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 		 191 aa  124  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  37.72 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  38.32 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  33.9 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  35.59 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.2 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  34.04 
 
 		 217 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  31.95 
 
 		 220 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  31.14 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  33.69 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  34.22 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  28.99 
 
 		 149 aa  85.9  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  32.84 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  33.69 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.97 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  28.99 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  24.85 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.8 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  21.39 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  27.01 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  26.06 
 
 		 859 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  29.73 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  27.37 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.22 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  26.2 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  26.2 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.07 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.2 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.16 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.32 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.49 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  25.93 
 
 		 186 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  20.79 
 
 		 180 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  25.53 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.7 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>