73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1611 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  74.19 
 
 		 186 aa  295  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  69.89 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.05 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  35.26 
 
 		 859 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.96 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.69 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  29.26 
 
 		 211 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  29.38 
 
 		 204 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  31.72 
 
 		 181 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  32.04 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.11 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  30.81 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  34.78 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  30.56 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  25.95 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  29.05 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  26.6 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  28.41 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  27.47 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  27.98 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  27.98 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  27.98 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  27.98 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  27.98 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.33 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  28.02 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  27.01 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.26 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.88 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  28.39 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  22.35 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.65 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  22.6 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  25.97 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.36 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.74 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  21.54 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.89 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  28.15 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  29.2 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.14 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.39 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.44 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  26.23 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  26.23 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.23 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  25.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  25.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  25.55 
 
 		 190 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  23.46 
 
 		 186 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>