80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1494 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  42.19 
 
 		 859 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.81 
 
 		 210 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  36.36 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  35.83 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  32.62 
 
 		 186 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  30.73 
 
 		 217 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  31.62 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  28.67 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  28.19 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.49 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  27.53 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.34 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.97 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  27.27 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  26.26 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  25.13 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  25.95 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  25.95 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  25.18 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  25.64 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  25.84 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  24.48 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  24.84 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  26.21 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  25.13 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.17 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  25.13 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  22.99 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  23.49 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  27.91 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.74 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.21 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  26.21 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.81 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  25.81 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  22.58 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  22.03 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 176 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.81 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.46 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  25.16 
 
 		 182 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  30.22 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  21.39 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  26.21 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 		 176 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  22.83 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  25.52 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.97 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  26.97 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.03 
 
 		 174 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.4 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  25.53 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  26.53 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  25.5 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  23.53 
 
 		 179 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  26.89 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  25.56 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  25.4 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  22.14 
 
 		 176 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  24.6 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  29.75 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.83 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  22.86 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  24.11 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>