106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6153 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 191 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.61 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  52.07 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  52.07 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  52.07 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  52.07 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  52.07 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  52.07 
 
 		 193 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  47.51 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  49.7 
 
 		 185 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  53.85 
 
 		 187 aa  157  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  51.48 
 
 		 187 aa  157  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.59 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  48.62 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  47.59 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  46.96 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  47.51 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  46.96 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  46.41 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  40.44 
 
 		 204 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.89 
 
 		 236 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  42.22 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  42.47 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  36.61 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  36.07 
 
 		 207 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  42.61 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  40.91 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.44 
 
 		 181 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  43.68 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  39.13 
 
 		 211 aa  121  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  38.33 
 
 		 217 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  39.16 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  34.5 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  34.05 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  36.84 
 
 		 192 aa  99  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  31.35 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.22 
 
 		 194 aa  84.7  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  29.89 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  32.97 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  31.18 
 
 		 859 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  32.16 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  31.48 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  30.18 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.12 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  34.56 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  28.34 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  30.41 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  29.57 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30.05 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  29.32 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 		 176 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.65 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  28.77 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  29.05 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  29.6 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  27.64 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  30.77 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  27.27 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  23.6 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  26.43 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.11 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  26.21 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  32.84 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.76 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.55 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.12 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  27.37 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  28.7 
 
 		 229 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  26.98 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  27.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  27.46 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.89 
 
 		 184 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.65 
 
 		 185 aa  42  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>