63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7432 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.43 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  48 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  47.43 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  46.86 
 
 		 181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  43.2 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  43.11 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  124  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  41.18 
 
 		 187 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.32 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  41.18 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.68 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  42.35 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  40.61 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  36.26 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  39.53 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  40.24 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.96 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  40.61 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  40.61 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.88 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  30.17 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  32.12 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  37.72 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  35.82 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  29.88 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  29.71 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  32.56 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  28.26 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  26.6 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  30.52 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  28.42 
 
 		 859 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  26.88 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  25.27 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.9 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  29.05 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.08 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  26.44 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.16 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  32.73 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 180 aa  51.2  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  23.49 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.17 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  32.17 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  28.4 
 
 		 234 aa  48.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.42 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.22 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  25.93 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.14 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.95 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.47 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.47 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.47 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>