85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4499 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  92.39 
 
 
184 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  92.39 
 
 
184 aa  348  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  92.39 
 
 
184 aa  347  4e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  92.39 
 
 
184 aa  347  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  90.76 
 
 
184 aa  343  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  90.22 
 
 
184 aa  341  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  82.32 
 
 
187 aa  288  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  77.17 
 
 
185 aa  287  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  81.22 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  81.22 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  81.22 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  81.22 
 
 
193 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  81.22 
 
 
193 aa  287  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  81.22 
 
 
187 aa  287  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  80.66 
 
 
187 aa  284  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  75 
 
 
184 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  75.54 
 
 
184 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  49.45 
 
 
185 aa  161  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 
188 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.62 
 
 
191 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  44.32 
 
 
211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  51.47 
 
 
195 aa  134  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  43.7 
 
 
207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  42.96 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.54 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  39.46 
 
 
204 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  39.29 
 
 
181 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  38.69 
 
 
181 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.64 
 
 
181 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  37.99 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  37.27 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  40.24 
 
 
182 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.28 
 
 
190 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  39.84 
 
 
149 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  36.05 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.87 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  29.28 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  27.62 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
859 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  29.76 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3269  hypothetical protein  28.31 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290598 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.13 
 
 
213 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  29.44 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  28.39 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.8 
 
 
217 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.37 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  31.34 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  24.59 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.16 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.73 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  26.75 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.73 
 
 
229 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  26.75 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  29.58 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  30.43 
 
 
229 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 
172 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  27.68 
 
 
178 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.04 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.38 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.13 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  34.26 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
179 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 
180 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.66 
 
 
193 aa  44.7  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  33.6 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  25 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  26.61 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  28.12 
 
 
185 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.12 
 
 
185 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  28.12 
 
 
185 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
185 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  25 
 
 
234 aa  41.2  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 
173 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  29.27 
 
 
180 aa  40.8  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>