92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1632 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  61.5 
 
 
190 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  48.66 
 
 
193 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  46.52 
 
 
193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  45.89 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  42.39 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  39.56 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
176 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
176 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  41.3 
 
 
176 aa  131  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  36.76 
 
 
176 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  36.76 
 
 
176 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  38.67 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  36.22 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  34.41 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  35.33 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.11 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  36.11 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  36.67 
 
 
173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  37.34 
 
 
229 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 
200 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 
229 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.93 
 
 
220 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.51 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.86 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  28 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.88 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.39 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.93 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.72 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.17 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  30.41 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.35 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.31 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  33.53 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  25.34 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  27.81 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  29.92 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.6 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  24.36 
 
 
174 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  35.64 
 
 
190 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  24.31 
 
 
186 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.68 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.76 
 
 
210 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  21.57 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  21.57 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  21.57 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  21.09 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  26.49 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  25.64 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 
191 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.43 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.55 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  24.38 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  31.58 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  27.69 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  26 
 
 
180 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  20.79 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3973  transposase  26.09 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.21 
 
 
180 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  24.46 
 
 
179 aa  48.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.4 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  30.88 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  20.62 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  27.52 
 
 
192 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.2 
 
 
172 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  26.83 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  27.2 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  25.45 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  24.34 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.61 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25.19 
 
 
213 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  25.86 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  29.41 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  25.14 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  21.97 
 
 
186 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  21.62 
 
 
187 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  25.15 
 
 
181 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.5 
 
 
153 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.88 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.35 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  27.33 
 
 
183 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>