63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0484 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0484  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  34.91 
 
 		 207 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  34.91 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  35.37 
 
 		 204 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  40.14 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  32.74 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  37.65 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.14 
 
 		 236 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  36.05 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  38.71 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  35.88 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  37.42 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  37.42 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.18 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  94.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  34.08 
 
 		 185 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  38.06 
 
 		 187 aa  94.4  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.06 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  38.06 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  38.06 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  38.06 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  38.06 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  35.92 
 
 		 149 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.73 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  37.42 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  27.57 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  30.68 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0701  hypothetical protein  29.48 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  30.46 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7432  hypothetical protein  30.52 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.4 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.99 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  29.07 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  30.41 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0928  carboxymuconolactone decarboxylase  28.75 
 
 		 859 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.64 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3819  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.28 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  25.97 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  27.62 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  29.29 
 
 		 178 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  30.83 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1494  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.269396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  32.64 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.07 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  29.17 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.43 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  27.48 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.63 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  28.36 
 
 		 180 aa  42.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  26.24 
 
 		 189 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  22.22 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  26.52 
 
 		 176 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>