55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2949 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2949  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  403  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  28.25 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  27.89 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  24.85 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  26.95 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  25.17 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  34.38 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0851  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.29 
 
 
185 aa  58.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  26.22 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.27 
 
 
229 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  24.85 
 
 
170 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  26.49 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  25.62 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  25.78 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  24.16 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1176  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.14 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.44 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.15 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  23.29 
 
 
180 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  23.12 
 
 
179 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.32 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  23.27 
 
 
190 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1611  hypothetical protein  21.54 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  24.66 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  21.79 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  26.72 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  24.06 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  26.72 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 
173 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  24.06 
 
 
207 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  28.46 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.03 
 
 
180 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  27.42 
 
 
173 aa  44.7  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  25.86 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  27.19 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0712  hypothetical protein  21.02 
 
 
186 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  26.96 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  25 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  24.4 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.31 
 
 
236 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0594  hypothetical protein  23.23 
 
 
211 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  25 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
180 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  23.48 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  26.15 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  23.48 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.94 
 
 
178 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  23.48 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  23.48 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  23.48 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  23.48 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  23.48 
 
 
187 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>