99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2330 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  83.25 
 
 
229 aa  316  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  39.78 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  37.57 
 
 
176 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  37.02 
 
 
176 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  39.42 
 
 
193 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 
190 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 
176 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  32.6 
 
 
176 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  34.24 
 
 
178 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  31.84 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  32.04 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  31.49 
 
 
173 aa  99  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  35.16 
 
 
190 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.78 
 
 
179 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  31.91 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.55 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  32.35 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.92 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.88 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  34.06 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  27.48 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0805  carboxymuconolactone decarboxylase  31.21 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  28.48 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  30.61 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  25.18 
 
 
174 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  30.28 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
180 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  31.06 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  28.86 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  28.86 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  28.86 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  28.64 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  30.13 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7422  hypothetical protein  31.01 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.752552  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  28.65 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  25.9 
 
 
183 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.69 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  26.56 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.74 
 
 
178 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  32.31 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  31.47 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  32.31 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  29.66 
 
 
173 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  32.31 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0886  hypothetical protein  26.81 
 
 
186 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.48 
 
 
172 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  24.09 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  31.25 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1143  hypothetical protein  28.91 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245046  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.43 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  29.58 
 
 
184 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  26.67 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0028  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  26.56 
 
 
184 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  25.41 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  19.85 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  30.71 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  28.91 
 
 
193 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  28.91 
 
 
193 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  28.68 
 
 
195 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  28.91 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  29.41 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  28.12 
 
 
187 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  26.16 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  28.12 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1168  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.95 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0628655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1268  hypothetical protein  25.95 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.739045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  27.42 
 
 
187 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1334  hypothetical protein  22.15 
 
 
207 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  29.06 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2478  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.03 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00157967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  21.68 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1399  hypothetical protein  21.48 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0802655  normal  0.0447539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.26 
 
 
180 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  25.43 
 
 
180 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.89 
 
 
180 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>