74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1361 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0486  carboxymuconolactone decarboxylase  44.51 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0965  hypothetical protein  45.68 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  46.59 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.21 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  41.96 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  41.67 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  36.97 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  37.01 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1057  carboxymuconolactone decarboxylase  35.39 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.506281 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  35.9 
 
 		 234 aa  87.4  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  28.99 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  36.54 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  32.69 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  30.57 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4279  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.445226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4087  carboxymuconolactone decarboxylase  32.41 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  34.21 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3436  hypothetical protein  32.41 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.34 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1956  hypothetical protein  29.79 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0715147  normal  0.617384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  26.53 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3980  carboxymuconolactone decarboxylase  29.08 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395763  normal  0.33482 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.562513  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  30.84 
 
 		 229 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  27.36 
 
 		 217 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  27.1 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  27.1 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3217  alkylhydroperoxidase-like protein  29.73 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.52 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4499  carboxymuconolactone decarboxylase  31.72 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.85 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.78 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  25.47 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  28 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  27.93 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5881  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.16 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  30.1 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3497  carboxymuconolactone decarboxylase  28.37 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  27.84 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1070  alkylhydroperoxidase  29.13 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  27.68 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  28.12 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3981  hypothetical protein  28.16 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354663  decreased coverage  0.000440982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5221  carboxymuconolactone decarboxylase  25.77 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520498  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8880  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.05 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2352  hypothetical protein  27.86 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1625  hypothetical protein  24.5 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2093  hypothetical protein  26.43 
 
 		 187 aa  42  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0291682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  42  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  24.6 
 
 		 167 aa  42.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1401  hypothetical protein  26.43 
 
 		 187 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1121  hypothetical protein  26.43 
 
 		 187 aa  42  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3153  hypothetical protein  26.28 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2386  4-carboxymuconolactone decarboxylase  26.28 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1482  hypothetical protein  26.43 
 
 		 187 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6153  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.43 
 
 		 191 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5467  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.71 
 
 		 184 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  26.89 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3267  hypothetical protein  26.28 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.07 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  23.58 
 
 		 149 aa  41.2  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>