41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2914 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  32.73 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  29.67 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  28.65 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4627  carboxymuconolactone decarboxylase  29.88 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  27.88 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  28.03 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0015  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  34.04 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  27.74 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.34 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  28.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  31.34 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2958  carboxymuconolactone decarboxylase  32 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2075  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.21 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  34.09 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  30.3 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  29.92 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  29.73 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  32.35 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  26.62 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  28.79 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  28.79 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  28.79 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.52 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  26.16 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  35.92 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  25.47 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  28.67 
 
 		 229 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  27.5 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  24.68 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  27.56 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.54 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  30.22 
 
 		 184 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  26.88 
 
 		 176 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3805  carboxymuconolactone decarboxylase  36.84 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.565066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>