68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5095 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5095  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
190 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2405  carboxymuconolactone decarboxylase  43.41 
 
 
184 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.315014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0137  carboxymuconolactone decarboxylase  41.53 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6226  carboxymuconolactone decarboxylase  36.41 
 
 
184 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0960  carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 
180 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7488  carboxymuconolactone decarboxylase  39.89 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1053  carboxymuconolactone decarboxylase  34.44 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2975  alkylhydroperoxidase  30.72 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2839  carboxymuconolactone decarboxylase  38.1 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.242216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2440  carboxymuconolactone decarboxylase  31.79 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7089  carboxymuconolactone decarboxylase  28.73 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0757  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.48 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4779  carboxymuconolactone decarboxylase  34.65 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5137  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.39 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5226  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.528293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5518  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.707884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6281  carboxymuconolactone decarboxylase  32.84 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00558931  normal  0.0302802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4212  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0509659  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0319  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.82 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3120  Carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104846  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3758  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.284023  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3819  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3746  carboxymuconolactone decarboxylase  31.45 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.444516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3214  carboxymuconolactone decarboxylase  31.49 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1193  carboxymuconolactone decarboxylase  30.67 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1632  carboxymuconolactone decarboxylase  27.08 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.543997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  31.15 
 
 
178 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4181  carboxymuconolactone decarboxylase  28.83 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.917886  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1659  carboxymuconolactone decarboxylase  29.41 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.9764 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5304  carboxymuconolactone decarboxylase  30.34 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.377989  normal  0.661983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11564  hypothetical protein  27.27 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10471  hypothetical protein  34.17 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.11 
 
 
178 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0110  carboxymuconolactone decarboxylase  37.84 
 
 
179 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819214  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3712  carboxymuconolactone decarboxylase  30.36 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  26.34 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.46 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3707  carboxymuconolactone decarboxylase  26.34 
 
 
176 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3670  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.7 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.681155  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2330  carboxymuconolactone decarboxylase  26.14 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2163  carboxymuconolactone decarboxylase  30.2 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175503  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1801  carboxymuconolactone decarboxylase  30.19 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3720  carboxymuconolactone decarboxylase  25.81 
 
 
176 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0111  carboxymuconolactone decarboxylase  26.47 
 
 
174 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.75447  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 
176 aa  47.8  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  25.55 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2914  carboxymuconolactone decarboxylase  35.14 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3237  carboxymuconolactone decarboxylase  29.83 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0525831  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3226  carboxymuconolactone decarboxylase  29.83 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3288  carboxymuconolactone decarboxylase  29.83 
 
 
190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.93763  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0798  carboxymuconolactone decarboxylase  36.04 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.833566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2233  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.19 
 
 
193 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4644  hypothetical protein  24.67 
 
 
177 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350838  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.85 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0646  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.825839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0626  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459666  normal  0.287262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0633  carboxymuconolactone decarboxylase  37.04 
 
 
178 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.57 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4676  carboxymuconolactone decarboxylase  28.19 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5286  Carboxymuconolactone decarboxylase  29.25 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0750237  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04023  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03690)  24.58 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573475  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41770  hypothetical protein  21.09 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1658  carboxymuconolactone decarboxylase  26.63 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  0.978426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  27.07 
 
 
180 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0281  carboxymuconolactone decarboxylase  26.79 
 
 
214 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.209486  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1361  carboxymuconolactone decarboxylase  26.5 
 
 
172 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4385  hypothetical protein  27.52 
 
 
181 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4316  carboxymuconolactone decarboxylase  26.32 
 
 
229 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>