19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1257 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1257  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 160 aa  316  7.999999999999999e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3408  response regulator  82.5 
 
 		 160 aa  263  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.594008  normal  0.220961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.53 
 
 		 176 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.21 
 
 		 176 aa  84.3  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.67 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0028  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.65 
 
 		 372 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.25 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3952  hypothetical protein  28.1 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0617  hypothetical protein  31.08 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  26.21 
 
 		 172 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0820  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.73 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1447  hypothetical protein  26.89 
 
 		 199 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218618  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2316  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.7 
 
 		 210 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.463838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.07 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3158  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.84 
 
 		 369 aa  41.6  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.84 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.45 
 
 		 184 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4179  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.13 
 
 		 377 aa  40.8  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  22.5 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>